拜仁慕尼黑股东由拜仁慕尼黑股份公司（FC Bayern München AG）所拥有，其中大部分股份属于拜仁慕尼黑俱乐部，但也有一部分是由其它个人和机构持有的。
拜仁慕尼黑俱乐部拥有该股份公司的绝大部分，约为99.6%的股份，其中90.25%的股份属于拜仁慕尼黑俱乐部自身，另外9.35%的股份由拜仁慕尼黑俱乐部基金会拥有。
拜仁慕尼黑股份公司的其它股东包括约翰·彼得森（John Petersson），他拥有股份公司的3.3%股份和卡尔·施特劳斯（Karl-HeinzStrobl），他拥有股份公司的0.07%股份。
此外，拜仁慕尼黑股份公司还有其它一些小股东，他们拥有股份公司总股本的0.03%。
总之，拜仁慕尼黑股东主要由拜仁慕尼黑俱乐部本身，以及拜仁慕尼黑基金会及其它一些小股东构成。
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