拜仁慕尼黑历届教练主要有：克劳斯·贝拉布尔（Klaus Toppmöller），朱利安·布兰特（Julian Nagelsmann），汉斯·克拉克（Hans-Dieter Flick），罗伯特·克拉克（Robert Klauck），奥利弗·莱比锡（Oliver Lipps），马克斯·罗纳（Max Rummenigge）等。
克劳斯·贝拉布尔（Klaus Toppmöller），他于2003年9月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他的任期被认为是拜仁慕尼黑的一段伟大历史，他在2004-2005赛季带领球队夺得欧冠冠军，并在2005-2006赛季拿到德国杯冠军，他在2006年4月离开拜仁慕尼黑，结束了他的拜仁慕尼黑历史。
朱利安·布兰特（Julian Nagelsmann），他于2019年7月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他是德国最年轻的教练，他在他的第一个赛季就带领球队夺得德甲冠军，并在2020-2021赛季带领球队夺得欧冠冠军，他的继任者汉斯·克拉克（Hans-Dieter Flick）也在2021赛季夺得欧冠冠军，延续了拜仁慕尼黑的传统。
汉斯·克拉克（Hans-Dieter Flick），他于2019年11月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他在2021赛季带领球队夺得欧冠冠军，在拜仁慕尼黑历史上，他是第六位夺得欧冠冠军的主教练，他更是在短短19个月里完成了这一伟大壮举。
罗伯特·克拉克（Robert Klauck），他于2008年7月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他是拜仁慕尼黑历史上第一位外籍教练，他在他的任期内，带领球队赢得了2009-2010赛季的德甲冠军和欧联杯冠军，他是拜仁慕尼黑历史上最成功的外籍教练。
奥利弗·莱比锡（Oliver Lipps），他于2011年3月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他在他的任期内，带领球队赢得了2014-2015赛季的德甲冠军，他在2016年4月离开拜仁慕尼黑，结束了他在拜仁慕尼黑的历史。
马克斯·罗纳（Max Rummenigge），他于2016年7月加入拜仁慕尼黑，担任主教练，他在他的任期内，带领球队赢得了2017-2018赛季的德甲冠军，他在2019年4月离开拜仁慕尼黑，结束了他在拜仁慕尼黑的历史。
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